jazyk / language:
INTERAKTÍVNA KONFERENCIA
MLADÝCH VEDCOV
Späť do sekcie

Expresia alkoholdehydrogenázy vo Vibrio natriegens

Diskusná interakcia
Celkové prevedenie (dizajn)
Vedecká práca
Schovať hodnotenia

Prejsť do diskusie

Expresia alkoholdehydrogenázy vo Vibrio natriegens

Kristína Macáková 1 Silvia Rybecká 1 Eva Struhárňanská 1 Monika Chovanová 1 Ľubica Kormanová 1 Viktor Varga 1 Zdenko Levarski 1,2 Stanislav Stuchlík 1,2

1Univerzita Komenského v Bratislave, Prírodovedecká fakulta, Katedra molekulárnej biológie, Mlynská dolina , Ilkovičova 6, 842 15 Bratislava, Slovenská republika
2Univerzita Komenského v Bratislave, Vedecký park, Ilkovičova 8, 841 04 Bratislava, Slovenská republika
kikusamacakova@gmail.com

Vibrio natriegens je gramengatívna, nepatogénna baktéria, ktorá je charakteristická svojou rýchlou generačnou dobou,< 10 min a vysokým obsahom ribozomálnej DNA. V našom experimente sme pracovali s komerčne dostupným kmeňom V. natriegenes s názvom VmaxTMExpress, ktorý je charakteristický deléciou niekoľkých génov extracelulárnych nukleáz a obsahom IPTG indukovateľnú T7-RNA polymerázovú kazetu [1]. Jedná sa o ľahko kultivovateľnú baktériu, na ktorú je možné aplikovať rovnaké techniky zaobchádzania ako v prípade E. coli. Uvedené vlastnosti by mohli viesť ku zníženiu časovej náročnosti a zefektívneniu ekonomických nárokov. Hlavným cieľom tejto práce je testovanie konkurencieschopnosti VmaxTMExpress ku doteraz využívanej E.coli a  optimalizácia expresie ADH1 vo VmaxTM Express, nakoľko je ADH1 využívaná  v rôznych  farmaceutických aplikáciách, pri získavaní  čistých enenatiomérnych  foriem niektorých liečiv  a taktiež  pri produkcii šesťuhlikatých vonných alkoholov pre kozmetický a farmaceutický priemysel [2].

Pri práci sme pozorovali rýchlejší rast kultúry Vmax ako E. coli. Vďaka tomu sme previedli indukciu expresie už po 1,5 h (hustota kultúry OD600 = 0,5) od preočkovania nočnej kultúry do čerstvého média, pričom u E. coli to bolo možné až po 2,5 h. Expresiu sme analyzovali pomocou  SDS-PAGE géloch. Expresia ADH1 v kmeni  VmaxTM Expres, bola efektívnejšia nakoľko percentuálne zastúpenie proteínu ADH1  voči celkovému obsahu produkovaných proteínov bolo vyššie ako v prípade E. coli. Rýchlejší nárast biomasy Vmax oproti E. coli sme potvrdili aj analýzou hmotnosti sušiny kultúry v časových intervaloch. VmaxTM Express dosahuje až dvojnásobne lepšie výsledky ako E. coli. Ďalšími krokmi v našej práci je testovanie schopnosti produkcie ADH1 v kmeni VmaxTM Express v  rôznych podmienkach ako je  zloženie média  a teplota rastu/ expresie. 

Poďakovanie: Príspevok je výsledkom realizácie projektov (APVV-17-0570, APVV-17-0333 a APVV-15-0466), projektu VEGA (1/0710/18), projektu „Univerzitný vedecký park Univerzity Komenského v Bratislave“ (ITMS 26240220086) a projektu BIOREKPROT (ITMS 26240220048) na základe podpory operačného programu Výskum a vývoj financovaného z ERDF.
[1] Weinstock M. T., Hesek E. D., Wilson C. M., et al. (2016)Nature methods13(10), p.849.
[2] Zheng Y. G., Yi H. H., Yu D. F., et al. (2017) Appl Microbiol Biotechnol 101(3), p.987.
Zdá sa, že Váš internetový prehliadač nepodporuje prehliadanie PDF dokumentov.
Pre zobrazenie súboru je potrebné maš nainštalovaný Adobe Reader.

Diskusia

Peter Bališ
Moderátor
expresia ADH 30.05.2019 13:15
Dobrý deň,

veľmi prospešná práca. Mám otázku na expresiu ADH, a pokles po troch hodinách vo vzorke E. coli a nasledný návrat. Keďže neuvádzate ani SEM ani SD v tomto prípade môÅ...
Zobraziť celý komentár
Re: expresia ADH 03.06.2019 22:50
Dobrý deň,
v prípade analýzy expresie sa neuvádza SEM ani SD nakoľko expresia nebola meraná v triplikátoch tak ako sušina. V tomto prípade bola meraná iba jedna vzorka pri danej teplote ke...
Zobraziť celý komentár
Naši partneri
Generálny partner

Partneri
Špeciálne poďakovanie
Mediálni partneri
Inzercia zadarmo
Usporiadateľ