Úvod:
Včasná iniciácia cielenej liečby môže predísť možným nevratným neurologickým komplikáciám spondylodiscitídy (SD) a/alebo spinálnych metastáz (MET), ktorých odlíšenie však môže najmä vo včasných štádiách predstavovať diagnostický problém.
Cieľ:
Identifikovať rádiomické prvky PET obrazu pomocou FDG, ktoré pomôžu rozlíšiť spondylodiscitídu od kostnej metastázy v chrbtici, a navrhnutie modelu na predikciu s adekvátnou diagnostickou presnosťou (80 %) pre klinické využitie
Metóda:
Retrospektívna analýza 31 rádiomických prvkov druhého a vyššieho rádu u 125 pacientov s potvrdenou SD (n=63) a MET rôznych malignít (n=62). Dokopy bolo analyzovaných 78 nálezov SD a 95 nálezov MET pomocou freeware LIFEx umožňujúceho výpočet konvenčných, textúrnych a tvarových prvkov diagnostických obrazov.
Pomocou štatistického softwaru RStudio boli porovnané klinické charakteristiky pacientov (neparametrický Wilcoxon rank sum test) a ich prijateľná diagnostická presnosť bola testovaná pomocou ROC krivky. Ďalej bola testovaná prediktívna schopnosť rozlišovania SD a MET pomocou machine learning, kde boli testované tri metódy (multiple logistic regression, random forest a support vector machines), s tromi rôznymi spôsobmi výberu tréningových a testovacích dát (K-fold cross-validation, Leave-One-Out Cross-Validation, Train test split).
Výsledky:
Pri odlíšení SD a MET bolo potvrdených 24/31 rádiomických prvkov ako štatisticky signifikantných (p<.05) a u 9/24 bola pre diagnostickú presnosť AUC>80%. Najvyššie hodnoty dosiahli parametre GLZLM_ZP (cut-off=0.38, AUC=83.25 %), NGLDM_Contrast (cut-off=0.17, AUC=84.7 %) a GLRLM_GLNU (cut-off=46.1, AUC=88.8 %). V machine learning bola najefektívnejšia metóda Random Forest so spôsobom výberu dát Train test split a s presnosťou 83.3 % (cut-off=0.28, AUC=98.61 %). Pri validácii tohto modelu sa dosiahla presnosť 93.41 % (cut-off=0.50, AUC = 97%).
Záver:
Výsledky potvrdzujú rádiomickú analýzu a machine learning ako možný smer pri odlíšení SD a MET.
Administrator
da sa na zaklade modelu strojoveho ucenia odhadnut, aka velka by musela byt treningova mnozina dat, aby vo vysledku algoritmus urcoval diagnozu presnejsie (alebo aspon t...Show all comments
Passive
Náš algoritmus v porovnaní s konvenčným prístupom vykazuje štatisticky signifikantnejšiu presnosť v určovaní diagnózy. Možno Vás zarazila o niečo nižšia presnosť v...Show all comments
Administrator
Passive
Moderator
Mna by zaujimalo ako ste na slide 17 statisticky porovnavali Model Random Forestu
rádiomických prvkov a SUVmax? Z coho je dana p-value?
Passive
P-value sa vypočítala podľa DeLongovej metódy s použitím algoritmu od Sun and Xu (2014) porovnaním AUC dvoch ROC kriviek. Táto metóda bola ešte vylepšená na počítanie aj unpa...Show all comments
Moderator
Passive