jazyk / language:
Interactive Conference
of Young Scientists
Back to section

Príprava rekombinantného plazmidu s inzertom šaperón-like génu z Cronobacter sakazakii pod indukovateľným lac wt promótorom

Discussion interaction
Overall design
Scientific work
Show all evaluations

Go to the discussion

Príprava rekombinantného plazmidu s inzertom šaperón-like génu z Cronobacter sakazakii pod indukovateľným lac wt promótorom

Linda Mihálová 1 Eva Struhárňanská 1 Monika Chovanová 1 Zdenko Levarski 1,2 Martin Šafranek 1 Stanislava Bírová 1 Silvia Rybecká 1 Stanislav Stuchlík 1,2 Ján Turňa 1,2

1Univerzita Komenského v Bratislave, Prírodovedecká fakulta, Bratislava 4, Slovenská republika
2Univerzita Komenského v Bratislave, Vedecký park, Ilkovičova 8, 84215 Bratislava 4, Slovenská republika
lindamihalova@gmail.com

Molekulárne šaperóny predstavujú špecializované proteíny, ktoré participujú pri správnom skladaní novovznikajúcich polypeptidov  („de novo folding“), v „refoldingu“ denaturovaných proteínov, a taktiež v ich proteolytickej degradácii [1]. Zistilo sa, že kmene rodu Cronobacter vlastnia genomický ostrov termotolerancie s veľkosťou 15kbp, v ktorom sa identifikovali viaceré gény stresovej odpovede, vrátane šaperón-like sekvencií, ako napr. gén orfD [2]. Pri heterológnej expresii rekombinantných proteínov vo vyššej koncentrácii býva jedným z negatívnych javov tvorba agregátov, tzv. inklúznych teliesok. Renaturácia takýchto agregátov prebieha v bunke E. coli s nízkou frekvenciou, v dôsledku čoho vzniká biologicky neaktívny proteín [3].

Hlavným cieľom našej práce je konštrukcia rekombinantného plazmidu s inzertom génu orfD pod indukovateľným lac wt promótorom.

V našej práci sme úspešne amplifikovali DNA fragmenty s orfD a orfC+D sekvenciami z kmeňa C. sakazakii LMG 5740 pomocou gradientovej PCR. V získaných transformantoch po ligácii vektora s oboma DNA sekvenciami sme pri skríningu zatiaľ nepotvrdili konštrukciu plánovaných rekombinantných plazmidov. V ďalšej práci budeme pokračovať v skríningu rekombinantného plazmidu s vloženým génom orfD, resp. orfC+D, kódujúcim šaperón pod kontrolou indukovateľného lac promótora. Následne využijeme konštrukty pri funkčných štúdiách.

Táto publikácia vznikla vďaka podpore projektov: „Univerzitný vedecký park Univerzity Komenského v Bratislave – 2. Fáza“ (ITMS 2014+ 313021D075), „Príprava biologicky aktívnych látok na báze rekombinantných proteínov“ (BIOREKPROT – ITMS: 26240220048) a „Rozvoj centra excelentnosti pre využitie informačných biomakromolekúl na zlepšenie kvality života“ (BIOMAKRO2 - ITMS 26240120027), financovaných zo zdrojov ERDF, financovaných zo zdrojov ERDF.
[1] Hartl F. U. (1996) Nature 381, p. 571.
[2] Orieskova M., Kajsik M., Szemes T. et al. (2016) Antonie van Leeuwenhoek 109: p. 405.
[3] Ellis R. J., Minton A. P. (2006) Biol. Chem. 387, p. 48.
It appears that your web browser does not support PDF documents viewing

Discussion

Preco orfD z C. sakazakii? 01.05.2018 09:48
Dobry den, chcem sa opytat, preco ste si vybrali ako ciel genovy produkt orfD z kmena C. sakazakii? Podla toho, co pisete v uvode, nie je zatial potvrdene, ze sa jedna o saperon z rodiny ClpB. Ked sa vam pod...Show all comments
Re: Preco orfD z C. sakazakii? 10.05.2018 14:05
Dobrý deň,

1. Kmeň C. sakazakii a orfD gén sme si zvolili na základe výsledkov predchádzajúcich štúdií rodu Cronobacter prebiehajúcich na našej katedre. Daný kmeň preukázal výz...
Show all comments
Partners
General partner

Partners
Special thanks
Media partners
Inzercia zadarmo
Organizer