jazyk / language:
Interactive Conference
of Young Scientists
Back to section

Post-translačné modifikácie a ich úloha pri regulácii ligačného kroku spájania nehomologických koncov DNA


Go to the discussion

Post-translačné modifikácie a ich úloha pri regulácii ligačného kroku spájania nehomologických koncov DNA

Kristína Stanová 1 Zuzana Grmanová 1 Danuša Vlasáková 1 Miroslav Chovanec 1

1Biomedicínske centrum SAV, Ústav experimentálnej onkológie SAV, Bratislava, Slovensko
stanova.kristina@gmail.com

Za jeden z najnebezpečnejších typov poškodenia DNA vznikajúcich v dôsledku pôsobenia rôznych endogénnych a exogénnych faktorov sú považované dvojvláknové zlomy DNA (DSB; Double-Strand Break). Zatiaľ čo neopravené DSBs vedú k bunkovej smrti, zle opravené DSBs často zapríčiňujú nestabilitu genómu, ktorá je považovaná za hlavnú hnaciu silu pri vzniku nádorov. Na prekonanie nebezpečenstva, ktoré DSB predstavujú, sa bunkám vyvinuli vysoko sofistikované opravné mechanizmy: homologická rekombinácia (HR; Homologous Recombination) a  spájanie nehomologických koncov (NHEJ; Non-Homologous End Joining). Zatiaľ čo HR vyžaduje homologickú sekvenciu pre opravu, NHEJ opravuje DSBs priamou ligáciou koncov. Stále viac sa do popredia v oprave DSBs dostáva aj úloha post-translačných modifikácií, ktoré môžu ovplyvňovať proteínové funkcie a regulovať opravné mechanizmy. V našej práci sa zaoberáme súhrou post-translačných modifikácii ligačného komplexu NHEJ. Ligačný komplex u S. cerevisiae pozostáva z ligázy Dnl4 a proteínov Lif1 a Nej1. Preukázalo sa, že Lif1 proteín podlieha SUMOylácii a ako hlavné SUMOylačné miesto sa javí lyzín v pozícii 301 [1]. Táto SUMOylácia funguje ako negatívny, na bunkovom cykle nezávislý regulátor NHEJ. Proteín Lif1 je tiež fosforylovaný na seríne 383 [2] a seríne 261 [3]. Pripravili sme mutantné kmene kvasiniek, nesúce rôzne kombinácie zámien aminokyselín v miestach, o ktorých bolo preukázané, že podliehajú fosforylácii alebo SUMOylácii. Na takto pripravených transformantoch sme následne merali účinnosť NHEJ v synchronizovaných kultúrach, ako i v jednotlivých fázach bunkového cyklu, s cieľom prispieť k porozumeniu súhry post-translačných modifikácií v oprave DSBs mechanizmom NHEJ.

Táto práca vznikla za podpory z Agentúry na podporu výskumu a vývoja (grantyčíslo APVV –0057–10 a APVV-14-0783) a vedeckej grantovej agentúry Ministerstva školstva SR a Slovenskej akadémie vied (VEGA 2/0056/14).
[1] Vigašová, Nucleic Acids Res., 2013, 41, 5341-5353.
[2] Matsuzaki, Genetics, 2008, 179, 213-225.
[3] Matsuzaki, Genes Cells, 2012, 17, 473-493.
It appears that your web browser does not support PDF documents viewing

Discussion

Miroslav Ferko
Administrator
marker 16.05.2016 20:51
Prajem pekny den, naozaj velmi skvela a zaujimava praca. Chcel by som sa opytat, ako daleko je v ramci danej studii potencialne vyuzitie ako onko-markera? Prajem vela uspechov do dalsieho napredovania.
Re: marker 18.05.2016 13:42
Dobry den, dakujem velmi pekne. Nasa studia sa zameriava na zakladny vyskum. Post-translacne modifikacie sa vyuzivaju aj ako onko-markery, neviem vsak zatial o prikladoch, kde by sa vyuzivali komponenty liga...Show all comments
Tereza Golias
Moderator
Ser383 24.05.2016 08:33
Aj mne sa praca velmi paci. :) Najma vidiet, ze k maximalnemu efektu je potrebne, aby Lys301 nebol SUMOylovany a Ser261 bol fosforylovany, resp. neSUMOylovany Lys301 a pozmeneny Ser383. Pri Ser383 je ta &...Show all comments
Re: Ser383 30.05.2016 08:16
Dobry den, dakujem pekne a ospravedlnujem sa za neskorsiu reakciu. Ser383 ma naozaj rovnaky efekt pri zamene za Ala aj Glu, co sa moze vysvetlit napr. tak, ze pri zmene aminokyselin doslo k zmene v strukture...Show all comments
Partners
General partner

Partners
Special thanks
Media partners
Inzercia zadarmo
Organizer