Analýza obsahu DNA vybraných kvasinkových druhov

Na základe poznatkov, že Candida utilis má 3- 5 krát vyšší obsah genómovej DNA v porovnaní so Saccharomyces cerevisiae [1] sme sa rozhodli definovať a porovnať množstvo genómovej DNA štyroch druhov kvasiniek. Na analýzu sme si zvolili kvasinky Pichia pastoris, Kluveromyces lactis a Saccharomyces cerevisiae, ktorých celkové množstvo DNA sme porovnávali s celkovou DNA C. utilis. Nakoľko je C. utilis polyploidná, predpokladali sme, že obsah jej DNA presiahne koncentrácie DNA ostatných kvasiniek, keďže kvasinky P. pastoris a K. lactis sú diploidné a S. cerevsiae sa nachádza prevažne v haploinom štádiu. Genómovú DNA sme izolovali pomocou klasickej izolácie a taktiež pomocou kitu od DNeasy Tissue Kit (Qiagen). Ďalším našim cieľom bolo stanoviť počet kópii maltázového génu u príslušných delečných multantov C. utilis pomocou Real Time PCR. Vychádzali sme z predpokladu, že divý typ C. utilis je tetraploid [1] a na základe tohto predpokladu sme očakávali, že počet kópii tohto génu bude u delečných mutantov znížený.