Charakterizácia lineárneho plazmidu pSA3239 v Streptomyces aureofaciens CCM3239
Erik Mingyár 1 Renáta Nováková 1 Renáta Knirschová 1 Ľubomíra Fecková 1 Carmen Bekeová 1 Ján Kormanec 1
Streptomycéty sú pôdne mikroorganizmy, ktoré sú zaujímavým objektom štúdia hlavne pre ich bohatý sekundárny metabolizmus. Sekundárne metabolity, produkované rôznymi kmeňmi streptomycét, sú zaujímavým objektom štúdia pre ich potenciálne využitie v rôznych odvetviach ako medicína, potravinárstvo, poľnohospodárstvo a pod. Najzaujímavejšie sekundárne metabolity sú antibiotiká, ktoré streptomycéty produkujú pravdepodobne na ochranu vlastných nahromadených živín [1].
Počas štúdií polyketid syntázového génového zhluku, aur1, ktorý je zodpovedný za tvorbu angucyklického antibiotika auricínu boli sekvenčnou analýzou pozorované gény homologické s génmi pre replikáciu lineárnych plazmidov streptomycét, gény potrebné pre prerozdeľovanie plazmidov a gény kódujúce proteíny, podieľajúce sa na ochrane telomérnych koncov [2].
Metódou pulznej gélovej elektroforézy bol v mikroorganizme Steptomyces aureofaciens CCM3239 identifikovaný lineárny plazmid s veľkosťou 240 kb. Okrem angucyklického antibiotika auricínu, boli na tomto plazmide pozorované aj iné sekundárne metabolity: zhluk génov aur2 kóduje zatiaľ neznámi sekundárny metabolit, zhluk génov bpsA kóduje modrý pigment indigo, zhluk génov pre metabolizmus síry a iné gény, kódujúce potenciálne sekundárne metabolity [2].
[2] Novakova, R. a kol. 2013. The gene cluster aur1 for the angucycline antibiotic auricin is located on a large linear plasmid pSA3239 in Streptomyces aureofaciens CCM 3239. In FEMS Microbiology Letters. ISSN: 1574-6968, 2013, vol. 342, p .130-137.