Inhibítory aldózareduktázy v prevencii diabetických komplikácií: predklinické štúdium kyseliny [5-(benzyloxy)-1H-indol-1-yl] octovej in vitro

Diskusia

Michal Májek
Pasívny

... 17.04.2013 13:03

Ahoj, rad by som sa spytal niekolko otazok k tvojej prezentacii: Ako si vysvetlujes, ze podla dockingu nie je velky rozdiel v energii komplexu lidorestat / alr2 verzus tvoja latka / alr2 (len ca 30 kj co nen...Zobraziť celý komentári vela) - a napriek tomu je priepastny rozdiel v aktivite (ic50 700 vz 5 nmol) - cim to asi je? Dalej - pises, ze v enzyme je interakcia s tyr his a trp - o aky typ interakcie sa jedna / dalo by sa to vyuzit pre navrh nejakych novych (aktivnejsich) latok? Dalej by ma zaujimalo, ako si izolovala enzymy alr1,2 z sosoviek / obliciek.

Marta Šoltésová Prnová
Pasívny

Re: ... 17.04.2013 15:15

Ahoj, ďakujem za zaujímavé otázky.Pre prehľadnosť budem odpovede číslovať.
1.Rozdiel energii v dockingu je práve dosť veľký. Rozdiely medzi energiami interakcie všeobecne nie sú až ta...Zobraziť celý komentárké číselne priepastné ako pri „klasickom“ IC50. Ten rozdiel je práve pomerne dosť veľký a naznačuje, že benzotiazolove jadro lidorestatu sa viaže na enzým a reaguje so zvyškami AMK „silnejšie“ ako metoxymetylbenzén (resp. benzén) z nami študovanej látky. Príkladom je aj pomer IC50 lidorestatu (5nM) a kysleiny 1-indoloctove (7uM), veľký rozdiel v IC50 ale relatívne malý rozdiel v Eint - -102 a -70,8 (samozrejme iný program a parametre použité na výpočet, Juskova et al., 2011).
2.Interakcie AMK -Interakcia týchto troch AMK zvyškov s inhibítorom je charakteristická pre inhibítory typu 1-indoloctová kyselina. Čiže podľa predchádzajúcich štúdii interakcie a štruktúra/účinok sme aj „vyberali“ sériu testovaných látok, z ktorých pochádza aj predmetná látka. Po prvom screaningu sa chceme zamerať práve na štúdium vplyvu rôznych substituentov na inhibičnú aktivitu.
5BOIAA tvorí vodíkovú v. so zvyškami spomínaných AMK.
3.Po homogenizácii šošovky/obličky sa izolujú oba enzýmy vysoľovaním.

Guest

Pridať komentár