Regulácia alternatívnych stresových sigma faktorov prostredníctvom anti-sigma faktorov a anti-anti-sigma faktorov v Streptomyces coelicolor A3(2)

Diskusia

Tomáš Grivalský
Pasívny

otazka 23.04.2013 19:34

Ahoj Erik, chcem sa opýtať na rozdielnosť sigma faktorov, či pri jednej stresovej situácii napríklad zmene pH dôjde k expresii vždy jedného alternatívneho sigma faktora alebo či to záleži od hod...Zobraziť celý komentárnoty stresu, teda v tomto prípadne od hladiny zmeny pH.
Ďalej sa chcem opýtať, či anti-sigma faktory majú rozdielnu doménu pre interakciu so sigma faktorom a pre anti-anti-sigma faktor alebo sa tieto domény prekrývajú?

Guest

Re: otazka 25.04.2013 20:43

Cau Tomas, dakujem za dobru otazku. Nielen streptomycéty, ale baktérie všeobecne sú komplexné organizmy s veľmi komplikovanou reguláciou. Znamená to teda, že pri vystavení sa stresu odpovedá mikro...Zobraziť celý komentárorganizmus zmenou génovej expresie, pričom pri určitom type stresu je prioritne aktivovaný určitý sigma faktor - uvediem príklad: Lee a kol. (2005) študovali časoví priebeh expresie v osmotickom strese (0,2M KCl) pomozou microarray a zistili že sa aktivuje jeden zo stresových sigma faktorov, ktorý transkribuje približne 280 génov, medzi ktoré patria ďalšie stresové sigma faktory (teda vzniká kaskádovitá dráha)...ak sa pozrieš na stresovú odpoveď v globále, ide o nesmierne komplikovanú reguláciu :-)
K druhej otázke ti odpoviem, že veľmi dobre preštudované sú sigma faktory, sú známe ich domény, aj to, ktorá doména na čo slúži. U anti-sigma faktorov je dnes pomocou bioinformatických štúdií možné nájsť kinázovú doménu a väzobnú doménu (Lee, 2005), prostredníctvom ktorej dochádza k interakcii s anti-anti sigma faktormi. Úplne presne sa väzobné domény ešte nepoznajú. Určite by pre presnú identifikáciu väzieb boli potrebné kryštalografické štúdie, ale myslím si, že z dôvodu obrovského množstva anti-sigma faktorov v S. coelicolor (až 48) nebude mechanizmus s interakčnými partnermi jednotný.

Guest

Pridať komentár