Črevný mikrobióm človeka plní dôležitú úlohu v rôznych fyziologických procesoch a v zdraví hostiteľa (1). Zahŕňa 500 – 1100 bakteriálnych druhov (2) a počas života človeka sa dynamicky mení (3). Cieľom tejto štúdie bolo zmapovať dynamiku bakteriálnej diverzity črevného mikrobiómu jedného probanda (muž, vek 34 r) a tak prispieť k lepšiemu pochopeniu jeho dynamiky. Pre účely tejto štúdie sa analyzovalo 6 vzoriek stolice odobratých počas dlhšieho obdobia v priebehu roka 2019, ktoré boli využité ako inokulačný materiál pre iné in vitro a in vivo pokusy. Pre analýzu mikrobiómu boli použité dva nezávislé postupy. NGS analýza bakteriálneho 16S metagenómu bola uskutočnená pomocou platformy Illumina MiSeq a mikrobiálne profily vzoriek sme stanovili aj pomocou PCR-DGGE. Analýza sekvenačných dát bola zameraná predovšetkým na bakteriálne kmene Bacteroidetes a Firmicutes. Ukázalo sa, že štruktúra črevného mikrobiómu probanda je počas sledovaného obdobia veľmi stabilná. Anaeróbne bakteriálne druhy dvoch majoritne zastúpených kmeňov Bacteroidetes a Firmicutes tvorili 78 – 91 % z celkového počtu baktérií. Rodové a druhové zastúpenie baktérií vykazovalo menšiu dynamiku v rámci kmeňa Bacteroidetes, kde zároveň dominovali druhy rodu Bacteroides, Parabacteroides, Alistipes a Barnesiella (spolu tvorili 53 – 62 % mikrobiómu). Najväčšiu druhovú rozmanitosť sme pozorovali pri kmeni Firmicutes so zreteľnou dominanciou druhov radu Clostridiales. Okrem toho bola v rámci kmeňa Firmicutes zaznamenaná najväčšia dynamika druhového zastúpenia. Uvedená štúdia dynamiky črevného mikrobiómu človeka naďalej pokračuje a plánuje sa rozšíriť o ďalších zdravých probandov, ale aj o pacientov s kolitídou vyvolanou toxigénnymi kmeňmi Clostridioides difficile, ktorí absolvovali transplantáciu fekálnej mikrobioty.
Administrátor
preco prave 9 mesiacov?
Dakujem, s pozdravom, PF
Pasívny
Dakujem za Vasu otazku. Odbery biologickeho materialu boli sucastou viacerych in vitro a in vivo pokusov, kde spracovany fekalny material sa vyuzil ako inokulum. Alternativna moznost ...Zobraziť celý komentár