jazyk / language:
INTERAKTÍVNA KONFERENCIA
MLADÝCH VEDCOV
Späť do sekcie

Glykoprofilovanie sér detí s poruchou aktivity a pozornosti (ADHD) microarray metódou založenou na lektínoch a hmotnostnou spektrometriou


Prejsť do diskusie

Glykoprofilovanie sér detí s poruchou aktivity a pozornosti (ADHD) microarray metódou založenou na lektínoch a hmotnostnou spektrometriou

Kristína Kianičková 1 Lucia Pažitná 1 Paras Kundalia 1 Zuzana Pakanová 1 Marek Nemčovič 1 Peter Baráth 1 Eva Katrlíková 2 Ján Šuba 2 Jana Trebatická 2 Seonghun Kim 3 Jaroslav Katrlík 1

1Chemický ústav SAV, Bratislava, SR
2Klinika detskej psychiatrie LFUK a NÚDCH, Národný ústav detských chorôb, Limbová 1, 831 01 Nové Mesto, Bratislava
3Jeonbuk Branch Institute, Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology (KRIBB), Jeongeup, Korea
k.kianickova@gmail.com

Porucha aktivity a pozornosti, známa tiež pod skratkou ADHD, je neurovývojové ochorenie charakteristické nepozornosťou, impulzivitou a hyperaktivitou u diagnostikovanej osoby. Najčastejšie je diagnostikované v školskom veku, avšak môže pretrvávať do dospelosti. Nakoľko chceme, aby ľudia s týmto ochorením mohli viesť plnohodnotný život a byť čo najlepšie začlenení do spoločnosti, je dôležité vyvíjať metódy umožňujúce jeho včasnú diagnostiku aj účinnú terapiu [1]. Pri výskume tohto ochorenia je dôležitý omický prístup, ktorý má dosah na zlepšenie jeho diagnostiky aj terapie.

V tejto práci sme sa zamerali na glykomickú analýzu vzoriek pacientov s ADHD. Glykozylácia je posttranslačná modifikácia proteínov, pričom je známe, že glykozylačné zmeny súvisia s mnohými ochoreniami vrátane neurovývojových. 70% všetkých ľudských proteínov je glykozylovaných a obsahuje jeden alebo viac glykánových reťazcov [2,3]. Glykány sú komplexné biopolyméry, ktoré možno rozpoznať na povrchoch buniek pomocou lektínov [4].  Tento typ biorozpoznávania sme využili pri analýze pacientskych vzoriek  microarray metódou založenou na lektínoch, pri ktorej sa pripravený microarray biočip s glykoproteínmi (vzorkami) naviazanými na upravený povrch (napr. sklo s epoxidovými skupinami) inkuboval so sadou biotinylovaných lektínov s rôznymi glykánovými špecifitami a potom s fluorescenčnou značkou obsahujúcou streptavidín [5]. Vzorky sme analyzovali aj hmotnostnou spektrometriou MALDI-TOF MS, kde boli glykány pred samotnou MS analýzou uvoľnené, prečistené a derivatizované [6,7].  V práci sme porovnávali vzorky sér, depletovaných sér  (bez IgG a albumínu) a frakcií obsahujúcich len IgG a albumín získaných od ADHD pacientov (n = 11) a kontrolnej skupiny (n = 10). Microarray metódou založenou na lektínoch sme medzi pacientskymi a kontrolnými vzorkami našli viacero rozdielov v ich glykánovom zložení. Pre hladinu významnosti α  = 0,01 sa v pacientskych vzorkách sér nachádzalo štatisticky významne viac fukózy (lektín rAAL), a menej GlcNac (lektín WGA) a tri-/tetraantenárnych N-glykánov (lektín PHA-L) oproti kontrolám, a v pacientskych vzorkách depletovaných sér menej Sia2,3 štruktúr (lektín MAL-II), vysoko manózových štruktúr (lektín GNL) a di-/triantenárnych N-glykánov obsahujúcich „bisecting“ GlcNAc (lektín PHA-E) vzhľadom na kontroly. Výsledky MALDI-TOF MS analýzy v prípade celých aj depletovaných sér poukazujú štatisticky významne zvýšenú fukozyláciu v pacientskych vzorkách oproti kontrolám, a v prípade depletovaných sér aj menej triantenárnych N-glykánov. Závery na základe analýz metódami microarray a MS sú navzájom v súlade, zhodujú sa taktiež so závermi práce venujúcej sa podobnému výskumu, využívajúcej však inú metódu [8]. Glykoprofilovanie je sľubným prístupom pri výskume aj tohto ochorenia a microrray metóda osobitne pri screeningu jeho potenciálnych biomarkerov.

Práca bola podporená vďaka projektom SK-KR-18-0004, APVV-17-0239, VEGA 2/0137/18, COST CA16113, COST CA18132, H2020 ITN synBIOcarb, Ministerstvom zdravotníctva SR v rámci projektu s registračným číslom 2019/7-CHÚSAV-4.
[1] Huang CL et al. (2020) Trends in incidence rates of diagnosed attention-deficit/hyperactivity disorder (ADHD) over 12 years in Taiwan: A nationwide population-based study, Psychiatry Research, 284, 112792, DOI: 10.1016/j.psychres.2020.112792.
[2] Zhang Y et al. (2018) Advances in sample preparation strategies for MS-based qualitative and quantitative N-glycomics, Trends in Analytical Chemistry, 99, 34-46.
[3] Yu H et al. (2020): Lectin microarrays for glycoproteomics: an overview of their use and potential, Expert Review of Proteomics, DOI: 10.1080/14789450.2020.1720512.
[4] Ribeiro JP, Mahal LK (2013) Dot by dot: analyzing the glycome using lectin microarrays, Current Opinion in Chemical Biology, 17, 827-831.
[5] Patwa T et al. (2010) Glycoprotein analysis using protein microarrays and mass spectrometry, Mass Spectrometry Reviews, 29, 830-844, DOI: 10.1002/mas.20269.
[6] Aizpurua-Olaizola O et al. (2018) Mass spectrometry for glycan biomarker discovery, Trends in Analytical Chemistry, 100, 7-14.
[7] Pažitná L et al. (2020) Influence of media composition on recombinant monoclonal IgA1 glycosylation analysed by lectin-based protein microarray and MALDI-MS, Journal of Biotechnology, 314-315, 34-40, DOI: 10.1016/j.jbiotec.2020.03.009.
[8] Pivac N et al. (2011) Human Plasma Glycome in Attention-Deficit Hyperactivity Disorder and Autism Spectrum Disorders, Molecular & Cellular Proteomics, 10, M110-00420.
Zdá sa, že Váš internetový prehliadač nepodporuje prehliadanie PDF dokumentov.
Pre zobrazenie súboru je potrebné maš nainštalovaný Adobe Reader.

Diskusia

Diskusia je zatiaľ prázdna, buďte prvý komentujúci
Naši partneri
Generálny partner

Partneri
Špeciálne poďakovanie
Mediálni partneri
Inzercia zadarmo
Usporiadateľ