Vzdialený ischemický conditioning (RIC) pozostáva z krátkych epizód ischémie nasledovaných reperfúziou v niektorej z častí organizmu. Prvé popísanie RIC sa pripisuje dvojici Whittaker a Przyklenk, ktorí predpokladali vylúčenie "protektívnych faktorov" po krátkych epizódach ischémie. Podobným je aj stav metabolického preconditioningu (MP). Metabolický preconditioning nastáva pri akútnom diabete a vo viacerých štúdiách bola preukázaná jeho ochranná účinnosť na srdcové mitochondrie (Malfitano et al., 2010). Zistilo sa, že diabetes má protektívnu funkciu vo viacerých patologických procesoch, ako napríklad ischémia, hypoxia a preťaženie vápnikom (calcium overload) (Schaffer et al., 2000; Champattanachai et al., 2007). V posledných rokoch sa v súvislosti s MP dostávajú čoraz viac do popredia mitochondriálne póry prechodnej permeability (mPTP). Presné molekulárne zloženie mPTP, spolu so všetkými regulačnými dráhami, však doposiaľ nie je známe. Za hlavné zložky sa v súčasnosti považujú ATP syntáza, cyklofilín D (CyPD), adenín nukleotidový translokátor (ANT) a napätovo závislý kanál (VDAC) (Pérez et al., 2017; Bernardi et al., 2015).

Vzhľadom na multienzýmový charakter mPTP predstavuje hmotnostná spektrometria vhodnú metódou na primárny a exploratívny výskum faktorov podieľajúcich sa na MP a zložení a regulácii mPTP. Neustálym zdokonaľovaním "label-free" kvantitatívnych metód je možné uskutočňovať komparatívno-kvantitatívne experimenty pre širokú škálu proteínov vo vzorkách. Jedným z najviac používaných kvantitatívnych ukazovateľov je exponenciálne modifikovaný "protein abundance index" (emPAI), použitím ktorého je možné relatívne kvantifikovať takmer všetky proteíny identifikované vo vzorke (Ishihama et al., 2005). Zvyšovaním komerčnej dostupnosti hmotnostných spektrometrov sa stávajú experimenty využívajúce hmotnostnú spektrometriu na identifikáciu a kvantifikáciu proteínov čoraz bežnejšie. Pomocou hmotnostnej spektrometie sme schopní získať veľké množstvo dát, ktoré sú navzájom prepojené a častokrát ťažko interpretovateľné. Tento problém si preto vyžaduje vytvorenie vhodných experimentálnych a analytických prístupov umožnujúcich správnu analýzu dát a zvýšenie spoľahlivosti výsledkov.