Spontánna hybridizácia druhov Pinus sylvestris L. a Pinus mugo Turra s. s. reprezentuje najstarší zaznamenaný prípad medzidruhovej hybridizácie v rode Pinus na území Európy [1]. Napriek tomu ide o aktuálnu problematiku, nakoľko hybridizačný proces ako taký má ďalekosiahly význam, a to z hľadiska biológie, ekológie a populačnej genetiky. Evolučný potenciál, ako aj ekologická plasticita hybridných rojov borovíc, sa vysvetľuje výrazným rozšírením ich vnútro-populačnej genotypovej variability v dôsledku introgresie [2]. Z uvedených dôvodov sa všeobecne uznané hybridné zóny zmienených taxónov na severnom Slovensku považujú za unikátnu príležitosť na štúdium mikroevolučných procesov „in situ“. V snahe o populačno-genetickú charakterizáciu týchto vzácnych stenoendemických populácií sa v súčasnosti najčastejšie využívajú reštrikčné profily cpDNA ako druhovo-špecifické markery. Absencia druhovo špecifického markera mtDNA však znemožnuje identifikáciu materského jedinca v simultánnej analýze cpDNA a mtDNA, čo je nevyhnutné pre jednoznačnú charakterizáciu hybridných rojov a potvrdenie ich hybridnej povahy [3]. Cieľom predloženej práce je za využitia pomerne novej metódy DNA fingerprintingu, iPBS (inter-Primer Binding Site) [4], pokúsiť sa o substitúciu vyššie zmienenej simultánnej analýzy (v súčasnosti nepoužiteľnej) pri určovaní genetickej štruktúry a diverzity hybridných rojov na severe Slovenska, konkrétne na lokalite Habovka, Tisovnica, Suchá Hora a Obšívanka. Ako kontrolu sme zvolili viac-menej izolované populácie čistých druhov P. sylvestris a P. mugo. Polymorfizmus detekujeme na základe DNA izolovanej z ihlíc [5] a následnej iPBS amplifikácii pomocou jedného primera v PCR reakcii. Naamplifikované fragmenty reprezentujúce inter-PBS sekvencie jadrového genómu, t. j. úseky DNA medzi doménami PBS dvoch kópií retrotranspozónu, sú separované elektroforeticky. V práci bola potvrdená zvýšená miera vnútropopulačnej genetickej variability pri hybridných jedincoch v porovnaní s jedincami pochádzajúcimi z kontrolných populácií P. sylvestris a P. mugo.