jazyk / language:
INTERAKTÍVNA KONFERENCIA
MLADÝCH VEDCOV
Späť do sekcie

Stanovenie citlivosti PCR s ITS3/4 primermi využívanej pri diagnostike Malassezia spp.


Prejsť do diskusie

Stanovenie citlivosti PCR s ITS3/4 primermi využívanej pri diagnostike Malassezia spp.

Zuzana Sihelská 1

1Univerzita veterinárskeho lekárstva a farmácie v Košiciach, Košice, Slovenská republika
zuzana.sihelska@uvlf.sk

rRNA génový komplex je často využívaný pri skúmaní a identifikácii kvasiniek. Pozostáva z mnohonásobných kópií génových oblastí: 18S, 5.8S, 26(28)S a 5S. 18S predstavuje malú podjednotku (Small subunit – SSU) a 28S je označený ako veľká podjednotka (Large subunit – LSU). Medzi podjednotkami sú vložené ďalšie dva regióny, a to ITS1 a ITS2 región (Internal transcribed spacer region) a IGS1 a IGS2 región (Intergenic spacer region). Génové oblasti u jednotlivých druhov rodu Malassezia majú viac alebo menej konštantnú dĺžku: SSU – 1800 bp, 5.8S – 160 bp, LSU – 3500 bp a 5S – 120 bp.1 Najčastejšie sa pri diagnostike rodu Malassezia využíva PCR ITS2 regiónu s primermi ITS3 a ITS4.2 Tieto primery boli navrhnuté pre diagnostiku fungálnych rodov Candida, Trichophyton, Malassezia, atď.Diagnostika malassezií je komplikovaná. Cieľom práce bolo stanoviť citlivosť  PCR reakcie s ITS3  a ITS4  primermi pre určenie rodu Malassezia. Pri zisťovaní citlivosti PCR reakcie s jednotlivými pármi primerov sa využil referenčný kmeň M. pachydermatis (CBS 1879).  Reakcia zachytáva ešte 1 ng templátovej DNA a je dostatočne citlivá pre bežnú diagnostiku malassezií.

Táto práca bola podporovaná Agentúrou na podporu výskumu a vývoja na základe Zmluvy č. APVV-15-0377.
1SCOTT, D. W., MILLER, W. H., GRIFFEN, C. E.: Muller and Kirk’s small animal dermatology (ed 6). Philadelphia, W.B. Saunders Company, 2001:526.
2YAPAR, N. Epidemiology and risk factors for invasive candidiasis. Ther Clin Risk Manag 2014;10:95-105.
3CABAÑES, F.J. Malassezia Yeasts: How Many Species Infect Humans and Animals? PLoS Pathog 2014;10:1-4.
Zdá sa, že Váš internetový prehliadač nepodporuje prehliadanie PDF dokumentov.
Pre zobrazenie súboru je potrebné maš nainštalovaný Adobe Reader.

Diskusia

Diskusia je zatiaľ prázdna, buďte prvý komentujúci
Naši partneri
Generálny partner

Partneri
Špeciálne poďakovanie
Mediálni partneri
Inzercia zadarmo
Usporiadateľ