jazyk / language:
INTERAKTÍVNA KONFERENCIA
MLADÝCH VEDCOV
Späť do sekcie

Fragmenty ľudského lyzozýmu vs. amyloidná agregácia lyzozýmu


Prejsť do diskusie

Fragmenty ľudského lyzozýmu vs. amyloidná agregácia lyzozýmu

Katarína Uličná 1,2 Zuzana Bednáriková 1,3 Anirban Bhunia 4 Zuzana Gažová 5

1Ústav experimentálnej fyziky SAV, Košice
2Ústav biologických a ekologických vied, Prírodovedecká fakulta, UPJŠ, Šrobárová 2, 041 54 Košice
3Ústav chemických vied, Katedra biochémie, Prírodovedecká fakulta, UPJŠ, Šrobárová 2, 041 54 Košice
4Oddelenie biofyziky, Bose Institute, P-1/12 CIT Scheme VII (M), Kolkata 700054, India
5Ústav experimentálnej fyziky, Oddelenie biofyziky, SAV, Watsonova 47, 040 01Košice
ulicna@saske.sk

Amyloidná agregácia proteínov je spojená s mnohými ochoreniami akými sú Alzheimerova choroba, diabetes mellitus a rôzne priónové ochorenia [1]. Molekulárnym základom týchto ochorení sú intermolekulárne interakcie  nenatívnych konformérov, ktoré vedú  k formovaniu amyloidných agregátov s vysokým obsahom  krížovej β-štruktúry [2, 3].

V našej práci sme sa zamerali na štúdium vplyvu Lz - peptidov, krátkych fragmentov ľudského lyzozýmu na amyloidnú agregáciu lyzozýmu. Aminokyselinová sekvencia Lz-peptidov odpovedala amyloidogénnej sekvencii lyzozýmu R107-R115 (Lz peptid) alebo bola modifikovaná zvýšením kladného náboja nahradením Ala2Lys (LzK peptid). Ďalšou modifikáciou Ala5Trp došlo v peptide LzKW okrem zvýšenia náboja, aj k zvýšeniu hydrofobicity. Našim cieľom bolo zistiť, či zmena náboja a/alebo hydrofobicity aminokyselinového reťazca má vplyv na anti-amyloidné vlastnosti Lz-peptidov.  Použili sme nato rôzne spektroskopické techniky (viazanie tioflavínu T (ThT) a kruhový dichroizmus (CD)) a atómovú silovú mikroskopiu (AFM).

Výsledky získané pomocou ThT metódy ukazujú, že Lz-peptidy v študovanom koncentračnom rozsahu (10 pM - 1 mM) ovplyvňujú fibrilizáciu ľudského lyzozýmu (10 μM). V prípade Lz a LzK peptidu sme pozorovali postupné znižovanie hodnôt fluorescencie ThT s rastúcou koncentráciou peptidov. Pre koncentrácie vyššie ako 100 nM sme pozorovali pokles fluorescencie k hodnotám 60% (Lz peptid), resp. 50% (LzK peptid) oproti hodnotám detegovaným pre lyzozýmové fibrily samotné (100%, kontrola). Prítomnosť LzKW peptidu nespôsobila výrazné zmeny v hodnotách fluorescencie ThT v celom študovanom rozsahu, čo naznačuje, že LzKW peptid nie je schopný inhibovať amyloidnú agregáciu ľudského lyzozýmu. Účinok Lz-peptidov bol pozorovaný aj pomocou kruhového dichroizmu. CD spektrum fibríl ľudského lyzozýmu (10µM) malo typické spektrum odpovedajúce vysokému obsahu β-listov s lokálnym minimom pri 222 nm. Zmeny v tvare spektier získané po fibrilizácii lyzozýmu  v prítomnosti Lz a LzK-peptidov (60µM) poukazujú na nižšie množstvo β-listov a vyšší podiel α-helixov v porovnaní s lyzozýmovými fibrilami. LzKW peptid (60µM) spôsobil len minimálne zmeny spektra oproti lyzozýmovým fibrilám, čo naznačuje podobné zastúpenie prvkov sekundárnej štruktúry. Atómová silová mikroskopia potvrdila výsledky získané metódou viazania ThT. Lyzozýmové fibrily mali typickú morfológiu amyloidných fibríl (dlhé, tenké vlákna). Amyloidná fibrilizácia lyzozýmu v prítomnosti Lz alebo LzK peptidov spôsobila výraznú redukciu množstva amyloidných agregátov. Na druhej strane, v prípade LzKW peptidu sme nepozorovali redukciu ani zmeny v morfológii vznikajúcich fibríl.

Naše výsledky indikujú, že krátke fragmenty lyzozýmu majú schopnosť ovplyvniť tvorbu amyloidných agregátov lyzozýmu, pričom dôležité bolo ich aminokyselinové zloženie. Ukázalo sa, že zvýšenie náboja vo fragmente LzK nespôsobilo zmeny voči aktivite pozorovanej pre Lz peptid.  Zvýšenie hydrofobicity fragmentu LzKW viedlo k podstatnému poklesu inhibičnej aktivity v podstate až na minimálnu úroveň. Získané výsledky poukazujú na to, že Lz a LzK peptidy môžu tvoriť základ pre dizajn látok s potenciálnym využitím pri liečbe amyloidných ochorení.

Táto práca bola podporená projektom VEGA 2/018/13.
[1] T. P. Knowles, M. Vendruscolo and C.M. Dobson, Nat. Rev. Mol. Cell. Biol. 15 (6) (2014), 384-96.
[2] C. Haass, D.J. Selkoe, Nat. Rev. Mol. Cell. Biol. 8 (2)  (2007), 101-12.
[3] R. S. Harrison, P. C. Sharpe, Y. Singh, D.P. Fairlie, Rev. Physiol. Biochem. Pharmacol. 159 (2007), 1-77.
Zdá sa, že Váš internetový prehliadač nepodporuje prehliadanie PDF dokumentov.
Pre zobrazenie súboru je potrebné maš nainštalovaný Adobe Reader.

Diskusia

Model 13.05.2016 12:03
Dobrý deň, ďakujeme za zaujímavý príspevok do sekcie. Mám na Vás niekoľko otázok: Čo podmienilo výber Vášho experimentálneho modelu tvorby amyloidných fibríl a agregátov? Čím a do akej mi...Zobraziť celý komentár
Re: Re: Model 17.05.2016 09:57
Ďakujem za odpoveď. Pre budúcnosť myslite na upresnenie odchýlok v popise grafu (predpokladám, že myslíte štandardných odchýlok SD). Bez upresnenia čitateľ nevie, či sa interval viaže k variab...Zobraziť celý komentár
Re: Re: Re: Model 17.05.2016 10:49
Ďakujem veľmi pekne za Vašu radu.

Nie nie tie peptidy nie sú komerčne dostupné, boli syntetizované na základe požiadavok výskumu.
Re: Re: Re: Re: Model 17.05.2016 10:51
:) hm, nie lacná záležitosť. Držím palce. iwa
Re: Model 17.05.2016 08:23
Dobrý deň,
ďakujem pekne za Váš komentár.
Tento model tvorby amyloidných fibríl agregátov použitý v tejto práci bol zvolený z dôvodu, že ľudský lyzozým patrí k jedným z model...
Zobraziť celý komentár
Thioflavin T 18.05.2016 09:41
Pekná práca, chcela by som sa opýtať, že prečo ste si zvolili práve Thioflavín T a či ste skúsili okrem neho aj iné látky a ak áno aké výsledky ste dosiahli. Ďakujem
Re: Thioflavin T 20.05.2016 08:10
Ďakujem pekne. Viazanie Tioflavínu T patrí k základným technikám detekcie prítomnosti amyloidných fibrilárnych agregátov. Tioflavín T sa viaže do amylodiných fibríl, konkrétne do cross (krí...Zobraziť celý komentár
Re: Thioflavin T 20.05.2016 08:09
Naši partneri
Generálny partner

Partneri
Špeciálne poďakovanie
Mediálni partneri
Inzercia zadarmo
Usporiadateľ