jazyk / language:
INTERAKTÍVNA KONFERENCIA
MLADÝCH VEDCOV
Späť do sekcie

Využitie PCR-RFLP pri identifikácii animálnych druhov rodu Malassezia


Prejsť do diskusie

Využitie PCR-RFLP pri identifikácii animálnych druhov rodu Malassezia

Zuzana Sihelská 1

1Univerzita veterinárskeho lekárstva a farmácie v Košiciach, Košice, Slovenská republika
zuzana.sihelska@uvlf.sk

Lipofilné kvasinky patriace do rodu Malassezia sú súčasťou normálnej mikroflóry kože u ľudí a u zvierat. Zároveň však vystupujú ako oportúnne patogény a sú asociované s množstvom dermatologických ochorení. Najčastejšie môžu spôsobiť otitídy a dermatitídy u zvierat a u ľudí široké spektrum kožných ochorení a fungémie.1 V súčasnosti je potvrdená existencia 14 druhov: M. nana M. restricta, M. japonica, M. yamatoensis, M. dermatis, M. obtusa, M. furfur, M. sympodialis, M. globosa, M. slooffiae, M. pachydermatis, M. caprae, M. equina a M. cuniculi.2 Na presnú druhovú identifikáciu sa využívajú molekulovo-biologické analýzy, veľmi často PCR-RFLP podľa autorov Gaitanis a Velegraki (2006), ktorí pomocou PCR (ITS3 a ITS4 primery) a RFLP (AluI, BanI a MspA1I) odlíšili 11 druhov malassezií.3 V nasledujúcich rokoch boli opísané tri nové druhy M. caprae, M. equina a M. cuniculi, ktoré sa vyskytujú u zvierat.2;4 Doteraz nebola vytvorená PCR-RFLP metóda, ktorá by umožňovala identifikáciu všetkých druhov rodu Malassezia. Cieľom tejto štúdie bolo doplnenie pôvodnej PCR-RFLP diagnostiky o tri chýbajúce druhy. Pomocou génových sekvenácií M. caprae a M. equina boli určené veľkosti prepokladaných PCR a RFLP produktov, ktoré boli prakticky overené na referenčných kmeňoch. M. caprae a M. equina majú totožné veľkosti PCR a RFLP produktov (rozdiel 1bp) a nie je možné ich vzájomné odlíšenie. Rovnakú veľkosť má aj druh M. sympodialis zahrnutý v pôvodnej diagnostike. Doplnením PCR-RFLP diagnostiky sa zistilo, že nie je možná vzájomná diferenciácia až troch druhov malassezií (M. caprae, M. equinaM. sympodialis). Táto metóda v súčasnosti nie je vhodná pre identifikáciu druhov rodu Malassezia. Pri druhu M. cuniculi nebolo možné stanoviť veľkosti PCR a RFLP produktov z dôvodu neznámej sekvencie celého genómu.

1 Guillot, J., Chermette, R., Guého, E. Prévalence du genre Malassezia chez les mammiféres. J Mycol Méd 1994; 4:72-79.
2Cabañes, F.J, Vega, S, Castellá, G. Malassezia cuniculi sp. nov., a novel yeast species isolated from rabbit skin. Med Mycol 2011; 49:40-8.
3Gaitanis, G., Velegraki, A. Verifiable single nucleotide polymorphisms of the internal transcribed spacer 2 region for the identification of 11 Malassezia species. J Dermatol Sci 2006; 43:214-217. 
4Cabañes, F.J., Theelen, B., Castellá, G.,Boekhout, T. Two new lipid-dependent Malassezia species from domestic animals. FEMS Yeast Res 2007;  7:1064-1076.
Zdá sa, že Váš internetový prehliadač nepodporuje prehliadanie PDF dokumentov.
Pre zobrazenie súboru je potrebné maš nainštalovaný Adobe Reader.

Diskusia

Diskusia je zatiaľ prázdna, buďte prvý komentujúci
Naši partneri
Generálny partner

Partneri
Špeciálne poďakovanie
Mediálni partneri
Inzercia zadarmo
Usporiadateľ