jazyk / language:
INTERAKTÍVNA KONFERENCIA
MLADÝCH VEDCOV
Späť do sekcie

Rýchla identifikácia drevorozkladajúcich húb rodu Ganoderma na základe ITS-PCR-RFLP analýzy restrikčnou endonukleázou BsuRI


Prejsť do diskusie

Rýchla identifikácia drevorozkladajúcich húb rodu Ganoderma na základe ITS-PCR-RFLP analýzy restrikčnou endonukleázou BsuRI

Terézia Gašparcová 1 Svetlana Gáperová 1 Peter Pristaš 2 Ján Gáper 3,4

1Univerzita Mateja Bela, Fakulta prírodných vied, Katedra biológie a ekológie, Banská Bystrica, Slovenská republika
2Univerzita Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach, Prírodovedecká fakulta, Ústav biologických a ekologických vied, Katedra mikrobiológie, Košice, Slovenská republika
3Technická univerzita, Fakulta ekológie a environmentalistiky, Katedra biológie a všeobecnej ekológie, Zvolen, Slovenská republika
4Ostravská univerzita, Přírodovědecká fakulta, Katedra biologie a ekologie, Ostrava, Česká republika
gasparcova.terezka@gmail.com

Drevorozkladajúce trúdniky z rodu Ganoderma patria k významným pôvodcom hnilôb dreva živých drevín. Z územia Slovenska sú známe druhy: Ganoderma lipsiense (Batsch) G. F. Atk., Ganoderma australe (Fr.) Pat., Ganoderma carnosum Pat., Ganoderma pfeifferi Bres., Ganoderma lucidum (Curtis) P. Karst., Ganoderma resinaceum Boud., a Ganoderma valesiacum Boud. (Gáperová, 2001). Klasická identifikácia drevorozkladajúcich húb je založená hlavne na analýze a porovnaní anatomicko-morfologických charakteristík plodníc. V súčasnosti sú pri identifikácii húb tohto rodu v zahraničí stále viac využívané molekulárne metódy (Wang et al., 2009; Nusaibah et al., 2011; Wang et al., 2012; Cao et al., 2012; Zhou et al., 2015). Na Slovensku boli pomocou molekulárnej analýzy (ITS-PCR-RFLP) doteraz študované len dva druhy Ganoderma lipsiense a Ganoderma australe (Pristaš a Gáperová, 2001). 

Cieľom tejto štúdie bolo na základe ITS-PCR-RFLP analýzy vyvinúť rýchlu metódu pre identifikáciu týchto, klasickými metódami, niekedy len obtiažne identifikovateľných húb.

V štúdii sme analyzovali sedem vzoriek plodníc rodu Ganoderma, pochádzajúcich z rôznych lokalít a patriacich do štyroch druhov. Plodnice sme determinovali na základe anatomicko-morfologických charakteristík. Z čistých kultúr získaných z plodníc sme izolovali DNA a pomocou špecifických primérov amplifikovali ITS medzerník.

Použitím restrikčnej endonukleázy BsuRI v ITS-PCR-RFLP analýze sme získali druhovo špecifické RFLP profily druhov Ganoderma carnosum, G. pfeifferi, G. lipsiense a  G. australe. Vo všetkých prípadoch sme pozorovali perfektnú koreláciu medzi výsledkami ITS-PCR-RFLP analýzy a anatomicko-morfologickou charakteristikou plodníc. Analýzou štyroch izolátov G. lipsiense sme nedetegovali žiadnu vnútrodruhovú variabilitu.

Na základe našich pozorovaní môžeme predpokladať, že ITS-PCR-RFLP analýza už jednou restrikčnou endonukleázou je schopná rozlíšiť druhy rodu Ganoderma a predstavuje tak rýchlu alternatívnu metódu k náročnej anatomicko-morfologickej analýze. Pre overenie možností tejto metódy na rozlišovanie druhov rodu Ganoderma sú potrebné ďalšie experimenty.

Táto práca vznikla za podpory grantu VEGA No. 2/0087/14.
  1. [1] Cao, Y., Wu, S.-H., Dai, Y.-Ch., 2012: Species clarification of the prize medicinal Ganoderma mushroom ‘‘Lingzhi’’. Fungal Diversity, 56, 49–62.
    [2] Gáperová, S., 2001: Synantropné druhy v rode Ganoderma. Acta Facultatis Ecologiae, 8, 93–98.
    [3] Nusaibah, S.A., Latiffah, Z., Hassaan, A.R., 2011: ITS-PCR-RFLP Analysis of Ganoderma sp. Infecting Industrial Crops.  Pertanika Journal of  Tropical Agricultural Science, 34, 83–91.
    [4] Pristaš, P., Gáperová, S., 2001: K možnostiam využitia metódy PCR v mykológii. Polymerázová reťazová reakcia a jej použitie v  biologickom výskume a diagnostike. Košice : Ústav fyziológie hospodárskych zvierat SAV, 2001, 158–163.
    [5] Wang, D.-M., Wu, S.-H., Su, C.-H., Peng, J.-T., Shih, Y.-H., Chen, L.-CH., 2009: Ganoderma multipileum, the correct name for ‘G.  lucidum’ in tropical Asia. Botanical Studies, 50, 451–458.
    [6] Wang, X.-C., Xi, R.-J., Li, Y., Wang, D.-M., Yao, Y.-J., 2012: The Species Identity of the Widely Cultivated Ganoderma, ‘G. lucidum’  (Ling-zhi), in China. PLOS ONE, 7, e40857.
    [7] Zhou, L.-W., Cao, Y., Wu, S.-H., Vlasák, J., Li, D.-W., Li, M.-J., Dai, Y.-CH., 2015: Global diversity of the Ganoderma lucidum  complex (Ganodermataceae, Polyporales) inferred from morphology and multilocus phylogeny. Phytochemistry, 114, 7–15.
Zdá sa, že Váš internetový prehliadač nepodporuje prehliadanie PDF dokumentov.
Pre zobrazenie súboru je potrebné maš nainštalovaný Adobe Reader.

Diskusia

Diskusia je zatiaľ prázdna, buďte prvý komentujúci
Naši partneri
Generálny partner

Partneri
Špeciálne poďakovanie
Mediálni partneri
Inzercia zadarmo
Usporiadateľ