jazyk / language:
INTERAKTÍVNA KONFERENCIA
MLADÝCH VEDCOV
Späť do sekcie

Štúdium počiatku replikácie OriC v bunkách octových baktérií

Diskusná interakcia
Celkové prevedenie (dizajn)
Vedecká práca
Zobraziť všetky hodnotenia

Prejsť do diskusie

Štúdium počiatku replikácie OriC v bunkách octových baktérií

Juraj Bugala 1 Barbora Majorošová 1 Viera Cimová 1

1Univerzita Komenského, Katedra Molekulárnej biológie, Bratislava 4, Slovenská republika
Juraj.Bugala@gmail.com

V procese iniciácie replikácie DNA dochádza k interakcii replikačných proteínov so špecifickou oblasťou DNA, ktorá je označovaná ako OriC. Hlavným iniciačným proteínom je DnaA proteín [1]. Práve interakcia OriC a DnaA proteínu je základnou podmienkou pre úspešnú iniciáciu replikácie DNA. K tejto interakcii dochádza na špecifických sekvenciách v rámci OriC, tzv. DnaA boxoch [2]. Vo všeobecnosti platí, že počiatok replikácie pozostáva z dvoch funkčných oblastí. Prvou je DnaA väzobná oblasť a druhou AT bohatý región. DnaA oblasť má viacero DnaA viažucich oblastí, ku ktorým patria aj DnaA boxy. DnaA boxy sú asymetrické 9 nukleotidov dlhé špecifické motívy, ktorých sekvencia, počet a rozloženie odráža diverzitu organizmov [3]. DnaA boxy tvoria miesto pre naviazanie DnaA monomérov, ktoré interagujú s OriC a vytvárajú štruktúru, ktorá je schopná rozrušiť dvojzávitnicu DNA. Komplex OriC-DnaA vytvorí torzné pnutie v DNA helixe, to sa sústreďuje na AT bohatý región a spúšťa rozpletanie dvojvlákna. V predchádzajúcej práci sme identofikovali predpokladaný počiatok replikácie v Acetobacter pasteurianus. Zamerali sme sa na cielenú PCR mutagenézu DnaA boxov a následné overenie schopnosti mutovaných počiatkov replikácie viazať DnaA iniciačný proteín. Predpokladaný počiatok replikácie sme klonovali do vektoru pGEM Teasy a PCR sme mutovali jednotlivé DnaA boxy alebo ich kombinácie. U takto pripravených mutantných  formiem sme testovali väzbu s DnaA proteínm pomocou Electro Mobility Shift Assay.

[1] Wolański, M., Donczew, R., Zawilak-Pawlik, A., et al. (2015) Front. in Microbiology 5, p. 735.
[2] Saxena, R. (2013) OA Biochemistry 1(2), p. 13.
[3] Messer, W. (2002) FEMS Microbiology Reviews 26, p. 355.
 
 
Zdá sa, že Váš internetový prehliadač nepodporuje prehliadanie PDF dokumentov.
Pre zobrazenie súboru je potrebné maš nainštalovaný Adobe Reader.

Diskusia

Erik Mingyár
Pasívny
otazka 14.05.2015 18:38
Cau Juro, ak si dobre pamatam tak DnaA protein potrebuje na svoju aktivitu ATP. pridavali ste aj v EMSE do reakcii ATP, alebo sa v in vitro dokaze tento protein naviazat aj bez ATP. diky
Juraj Bugala
Pasívny
Re: otazka 18.05.2015 07:11
Ahoj Erik, dik za otazku. Nepridavali sme ATP do reakcie. DnaA sa dokaze viazat na silne DnaA boxy (9bp) aj bez ATP. ATP-DnaA sa ale dokaze viazat aj na tzv. slabe DnaA boxy (6bp), ale len ak v susedstve je ...Zobraziť celý komentár
Naši partneri
Generálny partner

Partneri
Špeciálne poďakovanie
Mediálni partneri
Inzercia zadarmo
Usporiadateľ